Admin Admin
Tổng số bài gửi : 56 Join date : 08/08/2010 Age : 38 Đến từ : DanPhuong_HaNoi
| Tiêu đề: Thông tin quan trọng về công nghệ sinh học thế giới, đầu năm 2011 Sun Apr 03, 2011 8:46 am | |
| Sante Gnerre và ctv. thuộc Đại Học Cambridge và ĐH Boston đã công bố trên tạp chí PNAS ngày 25-1-2011 (vol. 108 no. 4: 1513-1518) về công nghệ giải mã trình tự song song DNA (Massively parallel DNA sequencing technologies) như một cách mạng trong sinh học đối với bộ gen của lớp có vú. Nó có khả năng đọc hàng tỷ các trình tự ngắn có tính chất tương đối (khoảng100-base) với chi phí thấp. Cơ sở dữ liệu nàycó thể được sử dụng trong các ứng dụng y học. Người ta đã gặp nhiều khó khăn trước đây, khi sử dụng cơ sở dữ liệu để hình thành nên kết quả chất lượng cao của bộ gen mới nào đó- những genome của động vật có xương sống với nhiều đoạn phân tử lập lại. Ngày nay, việc tổng hợp genome như vậy từ cơ sở dữ liệu tương ứng với chuỗi trình tự ngắn với các phương tiện cũ (đắt tiền) thông qua máy có số lượng mạch mao dẫn khác nhau (capillary-based sequencing approach). Ở đây, các tác giả đã cải biên bằng cách phát triển một thuật toán phục vụ cho kỹ thuật “genome assembly” (tổng hợp các bộ gen), đó là ALLPATHS-LG. Áp dụng thuật toán này vào cơ sở dữ liệu “massively parallel DNA sequence” của người và chuột, tạo nên cái gọi là Illumina platform. Kết quả tạm thời cho thấy nó rất chính xác, có tính liền kề với quãng ngắn (short-range contiguity), có tính liên tục với quãng dài (long-range connectivity), và có tính bao phủ trên toàn genome. Đặc biệt là, mức độ chính xác của base rất cao (≥99.95%) và kích thước scaffold (N50 size = 11.5 Mb cho người và 7.2 Mb cho chuột) thông qua phương pháp “capillary-based sequencing”. Phần mềm thuật toán ALLPATHS-LG có thể tìm trên [You must be registered and logged in to see this link.] Xem chi tiết [You must be registered and logged in to see this link.] | |
|